Команда студентов специальности «Биохимическое производство» успешно стартовала в Отборочном этапе студенческого трека Олимпиады Кружкового движения Национальной технологической инициативы (КД НТИ) по направлению «Геномное редактирование».

Олимпиада КД НТИ – командная инженерная олимпиада школьников и студентов среднего профессионального и высшего образования. Ее предназначение – выявление и развитие талантливых людей с инженерным мышлением, способных решать междисциплинарные задачи. В 2020 году студенческий трек проводится по 7 профилям.

Команда Новосибирского химико-технологического колледжа им. Д. И. Менделеева сформирована из студентов второго и третьего курса специальности «Биохимическое производство» под руководством Светланы Александровны Косьяновой:

Лидия Бармина – победитель Финала VIII Национального чемпионата «Молодые профессионалы» (WorldSkills Russia)-2020 по компетенции «Геномная инженерия»,

Анастасия Ларина – участница Финала VIII Национального чемпионата «Молодые профессионалы» (WorldSkills Russia)-2020 по компетенции «Геномная инженерия»,

Екатерина Любецких и Михаил Кирсанов – студенты, проходившие подготовку к участию в Финале VIII Национального чемпионата «Молодые профессионалы» (WorldSkills Russia)-2020 «Геномная инженерия» на базе Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН).

Соревнования проходят в 2 этапа: отборочный (дистанционный) и заключительный (дистанционный либо очный в зависимости от профиля).

Задания отборочного этапа разработаны для того, чтобы лучше подготовить команды к решению задачи финала. Для понимания процессов, происходящих in vitro (в пробирке в лаборатории) необходимы знания о физико-химических основах происходящих реакций, особенно в случае участия в них различных ферментов. Для расчета компонентов реакционной смеси требуется знать и освоить на практике достаточно простые вычислительные действия. Сегодня практически любое исследование либо начинается с математического моделирования, либо заканчивается биоинформатическиманализом полученных экспериментальных данных. Для такой работы не всегда требуются мощные суперкомпьютеры или вычислительные кластеры, многие действия можно выполнить с использованием онлайн-сервисов и баз данных, а также при помощи доступного свободного программного обеспечения. Ну и, конечно, для понимания сути происходящего in vivo и in vitro, необходимы знания об основных молекулярно-генетических процессах.

Задачи, которые предстоит решать команде, выложены в три блока. Задания первого блока более простые и повторяют вопросы прошлых лет, задания последнего блока — самые сложные (и за них можно будет получить больше баллов), для решения каждой задачи у команды будет несколько попыток.

В первом блоке отборочного этапа наша команда уже набрала 15 баллов из 20 возможных.

Второй отборочный блок проходит с 15 по 28 декабря и состоит из нескольких частей. Теоретические задачи по молекулярной биологии направлены на проверку знаний в области инженерной биологии. Практические задания по биоинформатике предполагают работу с базами данных NCBI, а также в программе UGENE.

Третий блок будет проходить с 29 декабря 2020 по15 января 2021 года.

Участникам отборочного тура Олимпиады предложены задачи по генетической инженерии и геномному редактированию. Для их решения требуются компетенции исследователя, имеющего опыт работы (и выполнения расчетов) в молекулярно-биологической лаборатории, а также биоинформатика, свободно владеющего основными методами работы в программном пакете UGENE и онлайн-базах данных.

На заключительном этапе участникам команды-финалиста предстоит анализ продуктов работы системы геномного редактирования. Командам необходимо будет выделить двух "мокрых" биологов, которые на финальном этапе будут работать в лаборатории, и двух биоинформатиков.

«Мокрым биологам» предстоит работа с автоматическими дозаторами, расчеты реакционных смесей, они проводят эксперименты с применением следующих методов: ПЦР, спектрофотометрия, электрофорез в агарозном геле, трансформация клеток плазмидной ДНК.

Биоинформатики работают с программой UGENE, используют онлайн-сервисы, базы данных NCBI для решения биоинформатических задач.

Команды-победители выпускных курсов получают возможность поступить в магистратуры вузов-участников студенческого трека Олимпиады КД НТИ, а также предложения от партнеров. Команды-победители младших курсов получают интересные предложения и стажировки от разработчиков профилей.

Пожелаем команде Новосибирского химико-технологического колледжа им. Д. И. Менделеева удачи!

Для справки:
Геномное редактирование– современный метод инженерной биологии, позволяющий вносить точечные изменения в ДНК. Геномное редактирование открывает новые перспективы: от лечения наследственных заболеваний, вызванных мутациями, до создания новых организмов.

Профиль «Геномное редактирование» организован по инициативе Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН и Новосибирского государственного университета. Научный руководитель профиля — академик РАН Валентин Викторович Власов, партнерами и спонсорами профиля выступают российские компании, ведущие исследовательскую деятельность в области инженерной биологии, а также разрабатывающие свободное ПО.

Светлана Александровна Косьянова,
председатель предметно-цикловой комиссии специальности «Биохимическое производство»